Санаторий «Магадан» был основан 11 сентября 1947 года тружениками далекого Севера, профсоюза горнодобытчиков «Золото и платина» на месте бывшего имения графа Сергея Дмитриевича Шереметева, одного из самых высокообразованных и знатных людей начала ХХ столетия.

Этот удивительный по своим природно-климатическим свойствам уголок Черноморского побережья Кавказа был выбран представителями северного Дальстроя, чтобы создать базу отдыха для людей, работающих в условиях Крайнего Севера, на далеких горнодобывающих предприятиях Колымы и Чукотки. Северянам нужно было подумать, прежде всего, о своих детях, потому что детский растущий организм более требователен и к солнцу, и к купаниям, нежели организм взрослого человека. Вот тогда-то и возникла пионерская республика на берегу Черного моря, прославившаяся как один из лучших пионерских лагерей в стране. Под эгидой лагеря в «Магадане» были построены первые капитальные корпуса, преобразилась территория.

Отдых взрослых оставался на втором плане до начала 70-х годов, когда усилиями коллектива был создан пансионат с лечением, оборудована передовая по тем временам лечебно-профилактическая база.
В 80-90х годах намечались планы грандиозного строительства, моделировались будущие просторные корпуса для отдыха детей и взрослых, помещения для занятия физкультурой и спортом, разветвленная инфраструктура.
В 1992 году объединение «Северовостокзолото», в состав которого входил и пансионат «Магадан», в соответствии с принятыми новыми законами начало реформироваться. Предприятия, которые входили в его состав, получили юридическую и финансовую независимость, что в итоге привело к ликвидации объединения как органа управления золотодобывающей отраслью Колымы и Чукотки. Для пансионата «Магадан» это означало, прежде всего, потерю финансирования для завершения строительства девятиэтажного корпуса, лечебного корпуса с двумя бассейнами, стадиона, котельной и ряда других объектов.

В 1993 году на базе государственного предприятия «Пансионат «Магадан» 16 предприятиями, входившими в объединение «Северовостокзолото», было создано товарищество с ограниченной ответственностью, которое вскоре в 1994 было преобразовано в открытое акционерное общество «Пансионат «Магадан». Используя оставшиеся средства учредителей и свои собственные, коллектив пансионата под руководством Совета директоров, которым руководили Сулима А.И., Шапиро С.Н., Христов В.К., и генерального директора Мелконьян В.И. завершил собственными силами начатое иностранными фирмами строительство девятиэтажного корпуса со встроенной столовой на 400 мест, который и смог принять в 2000 году качественно новый контингент отдыхающих – уже не только жителей Магадана и Магаданской области, но и других регионов России: Москвы, Волгограда, Ростова-на-Дону, Екатеринбурга, Воркуты, Воронежа.
Одно из главных качественных изменений в статусе и уровне работы здравницы – в 2002 году бывший пансионат стал санаторием.

В настоящее время санаторий «Магадан» в России знают многие. Встреча с ним у огромного количества людей оставила неизгладимое и теплое воспоминание. Каждый год растет число семей, хранящих в альбомах памятные фотографии-реликвии, напоминающие о незабываемых днях отдыха в одной из лучших здравниц на берегу Черного моря.
На сегодняшний день в копилке достижений санатория "Магадан" - десятки почетных грамот, благодарственных писем администрации города Сочи, а также дипломов и сертификатов авторитетных организаций в области сервиса и туризма.

В адрес сотрудников "Магадана" постоянно поступают коллективные благодарственные письма от отдыхающих.
Ежегодно санаторий становится участником самых известных туристических выставок как всероссийских, так и международных.